DeepMind推出AlphaFold,可通过氨基酸序列预测蛋白质结构

来源:www.xjctc.net   时间: 2019-12-07

根据英国卫报的报道,12月4日,DeepMind的最新AI AlphaFold在周日在墨西哥坎昆举行的国际会议上成功预测了基于该基因序列的蛋白质的3D形状。

“蛋白质折叠”是分子折叠的一种形式。生物体由蛋白质组成,生物体的功能由蛋白质的形状决定。了解蛋白质如何折叠可以帮助研究人员更好地了解蛋白质本身的功能。

DeepMind开发了AlphaFold用于预测“蛋白质折叠”,并参与了该项目的结构预测评估(CASP)。 CASP是一年两次的蛋白质折叠奥运会,吸引了来自世界各地的研究团队。比赛的目的是根据氨基酸列表预测蛋白质的结构,这些氨基酸将每隔几天发送给参与的团队几个月。这些蛋白质的结构最近被传统方法破解为游戏的正确答案。

尽管是第一个参加比赛的人,AlphaFold在98名参与者名单中名列榜首,准确预测了43种蛋白质中25种蛋白质的结构。在同一组中获得第二名的参赛者只准确预测了3种类型。值得注意的是,AlphaFold专注于从头开始建模目标形状,而不使用先前解析的蛋白质作为模板。 AlphaFold在预测蛋白质结构的物理特性方面达到了高度的准确性,然后基于这些预测,可以使用两种不同的方法来预测完整蛋白质结构的构建。

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